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本文目录一览: 1、如何设计引物 2、设计qPCR引物

本文目录一览:

如何设计引物

避免二聚体和自身互补:设计引物时需要避免两个引物之间形成二聚体或自身互补,这会影响PCR效率和特异性。 进行特异性检测:使用软件工具进行特异性检测,以确保所选引物只扩增目标DNA序列而不扩增其他非特异性DNA。

引物的长度一般为15-30bp,常用的是18-27bp,但不应大于38,因为过长会导致其延伸温度大于74℃,不适于TaqDNA聚合酶进行反应。

特异性:引物最好在模板cDNA的保守区内设计。引物应与核酸序列数据库的其他序列无明显同源性,不应有连续8个碱基与待扩增区外序列完全互补。可对其进行BLAST检测进行验证。

设计qPCR引物

引物最好在模板cDNA的保守区内设计;(2)引物长度一般在15~30碱基之间,过长会导致其延伸温度大于74℃,不适于TaqDNA聚合酶进行反应;(3)引物GC含量在40%~60%之间,Tm值最好接近72℃。

PCR的技术的主要步骤:DNA变性:(90℃-96℃):双链DNA模板在热作用下,氢键断裂,形成单链DNA。退火:(60℃-65℃):系统温度降低,引物与DNA模板结合,形成局部双链。

引物长度在 20~25bp 较好,而且上下游引物间不要相差超过 5bp; 再就是看看 Tm 值,60℃左右,相差不要超过 1℃。

你实验的时候可以做一个NRT的对照看一下有没有基因组污染。我做好几个基因的引物就没有跨外显子设计,用的是R223 HiScript Ⅱ Q RT SuperMix for qPCR(+gDNA Wiper),每次NRT也没有扩增,去除基因组效果不错。

Tm值可以设置在55度(实验的时候可以用60度退火);产物长度,100-150bp(如果没有合适的引物,产物长度可以设置在80-200)。如需设计引物,可以微信搜索“为青生物”,由专业人员提供免费的荧光定量PCR引物设计服务。

是。根据qPCR引物设计与验证得知,严格的qPCR 引物设计,通常要求其中一条引物要跨外显子,最好在3端设计引物,产物的长度在 300bp 以内等。因此设计引物的时候,验证横跨外显子了。

primer5.0设计引物-如何用PRIMER5.0设计引物

1、②点击Primer进入引物设计界面。③点击引物设计界面上的search按钮进行搜索选项设定。④点击搜索选项界面上的OK按钮可得到引物设计结果。⑤选择分值高的引物对作为实验合成引物选项。⑥根据需要对引物进行编辑。

2、先下载好primer premier0软件,按注册机提示激活该软件,然后双击打开该软件。如下图示 然后进入NCBI数据库里面选择自己需要设计引物的基因,然后查找到该基因的DNA序列。

3、是正向、反向还是双向,在片段中的那个位置设计及引物的长度等等,设置好后一路OK点下去就行了,然后就会有引物出来供你选择了。

4、设计好后,点左上角的“edit”,再点“copy”,然后选择正向引物或反向引物,点击后就已经复制到剪切板里了。然后打开word、txt或者exel文件,直接ctrl+V粘贴即可。 ———save to database是存入了PP5自己的数据库中。

5、首先设计引物以前的清楚设计引物基本原则例如测序使用引物:测序用引物要求非常严格,不同于PCR用引物。

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